MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	TGG	2	6	25076	25081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891959
502	NC_013385	CTC	2	6	25122	25127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891959
503	NC_013385	CTG	2	6	25128	25133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891959
504	NC_013385	CTT	2	6	25140	25145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891959
505	NC_013385	GCG	2	6	25148	25153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891959
506	NC_013385	GCC	2	6	25168	25173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891959
507	NC_013385	GC	3	6	25217	25222	0 %	0 %	50 %	50 %	260891959
508	NC_013385	GCG	2	6	25227	25232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891959
509	NC_013385	A	6	6	25267	25272	100 %	0 %	0 %	0 %	260891959
510	NC_013385	ATA	2	6	25305	25310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260891959
511	NC_013385	GGA	2	6	25451	25456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891960
512	NC_013385	TGG	3	9	25509	25517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891960
513	NC_013385	CGG	2	6	25591	25596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891960
514	NC_013385	TTAC	2	8	25654	25661	25 %	50 %	0 %	25 %	260891960
515	NC_013385	TGG	2	6	25671	25676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891960
516	NC_013385	GCC	2	6	25681	25686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891960
517	NC_013385	AG	3	6	25712	25717	50 %	0 %	50 %	0 %	260891960
518	NC_013385	CCTTT	2	10	25730	25739	0 %	60 %	0 %	40 %	260891960
519	NC_013385	GCGGTG	2	12	25749	25760	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260891960
520	NC_013385	CTT	3	9	25781	25789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891960
521	NC_013385	GGA	2	6	25820	25825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891960
522	NC_013385	AAGA	2	8	25893	25900	75 %	0 %	25 %	0 %	260891960
523	NC_013385	GGA	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891960
524	NC_013385	AAGG	2	8	25986	25993	50 %	0 %	50 %	0 %	260891960
525	NC_013385	GGA	2	6	26036	26041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891960
526	NC_013385	CAT	2	6	26042	26047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891960
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528	NC_013385	AG	3	6	26184	26189	50 %	0 %	50 %	0 %	260891960
529	NC_013385	GGT	2	6	26222	26227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891960
530	NC_013385	CCAG	2	8	26228	26235	25 %	0 %	25 %	50 %	260891960
531	NC_013385	GTG	2	6	26268	26273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891960
532	NC_013385	CTC	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891960
533	NC_013385	GCG	2	6	26357	26362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891960
534	NC_013385	GGC	2	6	26382	26387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891960
535	NC_013385	GCCA	2	8	26408	26415	25 %	0 %	25 %	50 %	260891960
536	NC_013385	GCG	3	9	26505	26513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891960
537	NC_013385	CGG	3	9	26576	26584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891960
538	NC_013385	AGT	2	6	26585	26590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891960
539	NC_013385	GGGC	2	8	26679	26686	0 %	0 %	75 %	25 %	260891960
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541	NC_013385	CTAC	2	8	26747	26754	25 %	25 %	0 %	50 %	260891960
542	NC_013385	CGGG	2	8	26851	26858	0 %	0 %	75 %	25 %	260891961
543	NC_013385	GCTC	2	8	26881	26888	0 %	25 %	25 %	50 %	260891961
544	NC_013385	CCT	3	9	26960	26968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891961
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547	NC_013385	CTT	2	6	27000	27005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891961
548	NC_013385	CCT	2	6	27006	27011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891961
549	NC_013385	GGA	2	6	27016	27021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891961
550	NC_013385	GGAAG	2	10	27088	27097	40 %	0 %	60 %	0 %	260891961
551	NC_013385	GAA	2	6	27122	27127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891961
552	NC_013385	GGA	2	6	27190	27195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891961
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554	NC_013385	CAG	2	6	27215	27220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891961
555	NC_013385	AGA	2	6	27237	27242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891961
556	NC_013385	GATT	2	8	27276	27283	25 %	50 %	25 %	0 %	260891961
557	NC_013385	GCT	2	6	27311	27316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891961
558	NC_013385	GAG	2	6	27389	27394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891961
559	NC_013385	CGA	2	6	27632	27637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891962
560	NC_013385	GCG	2	6	27655	27660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891962
561	NC_013385	G	6	6	27701	27706	0 %	0 %	100 %	0 %	260891962
562	NC_013385	GACC	2	8	27719	27726	25 %	0 %	25 %	50 %	260891962
563	NC_013385	AGG	2	6	27790	27795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891962
564	NC_013385	GGC	2	6	27920	27925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891963
565	NC_013385	GAT	2	6	27949	27954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891963
566	NC_013385	CCCTT	2	10	27986	27995	0 %	40 %	0 %	60 %	260891963
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569	NC_013385	TCT	2	6	28107	28112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891963
570	NC_013385	GGGC	2	8	28120	28127	0 %	0 %	75 %	25 %	260891963
571	NC_013385	AGCG	2	8	28199	28206	25 %	0 %	50 %	25 %	260891963
572	NC_013385	CTT	2	6	28228	28233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891963
573	NC_013385	ATC	2	6	28238	28243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891963
574	NC_013385	TTC	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891963
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576	NC_013385	TTGCTG	2	12	28334	28345	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	260891963
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578	NC_013385	CTT	2	6	28417	28422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891963
579	NC_013385	TTC	3	9	28469	28477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891963
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581	NC_013385	TGA	2	6	28503	28508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891963
582	NC_013385	CAT	2	6	28546	28551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891963
583	NC_013385	AGG	2	6	28584	28589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891963
584	NC_013385	GTA	2	6	28655	28660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891964
585	NC_013385	AGC	2	6	28671	28676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891964
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588	NC_013385	CAA	2	6	28873	28878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260891964
589	NC_013385	TGG	2	6	28959	28964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891964
590	NC_013385	GAG	2	6	28970	28975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891964
591	NC_013385	GGA	2	6	28993	28998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891964
592	NC_013385	CTA	3	9	29008	29016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891964
593	NC_013385	GCC	2	6	29031	29036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891964
594	NC_013385	ACA	2	6	29106	29111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260891964
595	NC_013385	CGC	2	6	29134	29139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891964
596	NC_013385	TCG	2	6	29196	29201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891964
597	NC_013385	CTT	2	6	29311	29316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891964
598	NC_013385	TTC	2	6	29351	29356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891964
599	NC_013385	GC	3	6	29477	29482	0 %	0 %	50 %	50 %	260891964
600	NC_013385	GGT	2	6	29497	29502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891964
601	NC_013385	GGCG	2	8	29526	29533	0 %	0 %	75 %	25 %	260891964
602	NC_013385	CCA	2	6	29550	29555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891964
603	NC_013385	ACG	2	6	29601	29606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891964
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605	NC_013385	CAAGCT	2	12	29632	29643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260891964
606	NC_013385	CG	3	6	29707	29712	0 %	0 %	50 %	50 %	260891964
607	NC_013385	TGG	2	6	29724	29729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891964
608	NC_013385	AGA	2	6	29793	29798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891964
609	NC_013385	CGA	2	6	29833	29838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891964
610	NC_013385	AGA	2	6	29874	29879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891964
611	NC_013385	TGG	2	6	30006	30011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891964
612	NC_013385	GCG	2	6	30014	30019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891964
613	NC_013385	AGA	2	6	30124	30129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891965
614	NC_013385	TTCA	2	8	30150	30157	25 %	50 %	0 %	25 %	260891965
615	NC_013385	GGA	2	6	30206	30211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891965
616	NC_013385	GGT	2	6	30242	30247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891965
617	NC_013385	ACT	2	6	30262	30267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891965
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619	NC_013385	ACC	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891966
620	NC_013385	TGG	2	6	30596	30601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891966
621	NC_013385	GGCT	2	8	30667	30674	0 %	25 %	50 %	25 %	260891966
622	NC_013385	GCG	2	6	30682	30687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891966
623	NC_013385	TCT	2	6	30716	30721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891966
624	NC_013385	GAAG	2	8	30823	30830	50 %	0 %	50 %	0 %	260891966
625	NC_013385	GCA	2	6	30833	30838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891966
626	NC_013385	ATC	2	6	30856	30861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891966
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